Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sema3aO08665 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sema3aO08665 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sema3aO08665 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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