Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gm2888K7N746 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Elovl3-201ENSMUST00000043739 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gm2888K7N746 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms