Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Gm8356J3QPD3 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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