Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Gm2035J3QP87 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm2035J3QP87 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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