Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3727J3QM54 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms