Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Vmn1r34G3XA52 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms