Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sh3tc1G3X9F6 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh3tc1G3X9F6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms