Protein–RNA interactions for Protein: F6RXI4

BC067074, cDNA sequence BC067074, mousemouse

Predictions only

Length 2,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC067074F6RXI4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BC067074F6RXI4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BC067074F6RXI4 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms