Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Casc1-208ENSMUST00000204105 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Samd1D3YXK1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms