Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Clrn2B2RVW2 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Clrn2B2RVW2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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