Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2al1jA2BFR3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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