Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnksr1A2A9K7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnksr1A2A9K7 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnksr1A2A9K7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Cnksr1A2A9K7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnksr1A2A9K7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnksr1A2A9K7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Cnksr1A2A9K7 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cnksr1A2A9K7 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Cnksr1A2A9K7 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cnksr1A2A9K7 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms