Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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