Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Plod3Q9R0E1 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms