Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rabgef1Q9JM13 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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