Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
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Ccl28Q9JIL2 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ccl28Q9JIL2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
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