Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
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