Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Rnft1Q9DCN7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms