Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC50

Crot, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 612 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrotQ9DC50 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CrotQ9DC50 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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