Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm5904-201ENSMUST00000210286 865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
SrpraQ9DBG7 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms