Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pdzd9Q9D9M4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms