Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Gtf3c6Q9D8P7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms