Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Trappc6bQ9D289 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
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Trappc6bQ9D289 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Trappc6bQ9D289 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
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