Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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