Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Lrrc52-201ENSMUST00000036643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nus1Q99LJ8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms