Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Rcbtb2Q99LJ7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rcbtb2Q99LJ7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Rcbtb2Q99LJ7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms