Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Klhl22Q99JN2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms