Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Tspan1Q99J59 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Tspan1Q99J59 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.3 ms