Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smim11aQ99J19 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smim11aQ99J19 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smim11aQ99J19 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smim11aQ99J19 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Smim11aQ99J19 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
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Smim11aQ99J19 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Smim11aQ99J19 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Smim11aQ99J19 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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