Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klc3Q91W40 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klc3Q91W40 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms