Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ApobrQ8VBT6 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ApobrQ8VBT6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms