Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4U6

Top1mt, DNA topoisomerase I, mitochondrial, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Top1mtQ8R4U6 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Top1mtQ8R4U6 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Top1mtQ8R4U6 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Top1mtQ8R4U6 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Top1mtQ8R4U6 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Top1mtQ8R4U6 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Top1mtQ8R4U6 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms