Protein–RNA interactions for Protein: Q8R281

Vmn1r200, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r200Q8R281 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Vmn1r200Q8R281 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vmn1r200Q8R281 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms