Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Spire2Q8K1S6 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms