Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Nek9Q8K1R7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms