Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rab11fip3Q8CHD8 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rab11fip3Q8CHD8 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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