Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Pramef8Q8CE24 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms