Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Lrif1Q8CDD9 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Lrif1Q8CDD9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Lrif1Q8CDD9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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