Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ57

Gm10600, Predicted gene 10600, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10600Q8BQ57 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm10600Q8BQ57 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms