Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt40Q6IFX3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Krt40Q6IFX3 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms