Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nop58Q6DFW4 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Nhlrc2-201ENSMUST00000071423 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nop58Q6DFW4 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms