Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TrhQ62361 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TrhQ62361 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms