Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
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PcolceQ61398 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
PcolceQ61398 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
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