Protein–RNA interactions for Protein: Q60604

Scin, Adseverin, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScinQ60604 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ScinQ60604 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms