Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrrc47Q505F5 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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