Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pdp2Q504M2 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pdp2Q504M2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms