Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sf3b2Q3UJB0 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sf3b2Q3UJB0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms