Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Ssbp4Q3U4B1 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ssbp4Q3U4B1 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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