Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD16

Rubcnl, Protein RUBCNL-like, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnlQ3TD16 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RubcnlQ3TD16 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RubcnlQ3TD16 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms