Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cpne9Q1RLL3 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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